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Asgard (arquéia)

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Como ler uma infocaixa de taxonomiaAsgard
Prometheoarchaeum syntrophicum mostrando protuberâncias longas e ramificadas. Recriação artística em plasticina.
Prometheoarchaeum syntrophicum mostrando protuberâncias longas e ramificadas. Recriação artística em plasticina.
Classificação científica
Domínio: Archaea
Reino: Proteoarchaeota
Distribuição geográfica

Filos
"Lokiarchaeota" Spang et al. 2015
"Thorarchaeota" Seitz et al. 2016
"Odinarchaeota" Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka et al. 2017
"Heimdallarchaeota" Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka et al. 2017
Sinónimos
Eukaryomorpha

Asgard ou Asgardarchaeota[1] é um superfilo proposto que consiste em um grupo de arquéias não cultivadas que inclui Lokiarchaeota, Thorarchaeota, Odinarchaeota, Heimdallarchaeota.[2] O superfilo de Asgard representa os parentes procarióticos mais próximos dos eucariotos.[3][4][5]

Os Asgards eram conhecidos apenas a partir de fragmentos de DNA isolados de sedimentos do fundo do mar e outros ambientes extremos.[6]

No verão de 2010, foram analisados sedimentos de uma amostra de solo gravitacional capturado no vale do rift, na dorsal de Knipovich, no Oceano Ártico, perto do chamado local de ventilação hidrotermal do castelo de Loki. Horizontes específicos de sedimentos previamente mostrados para conter grandes abundâncias de novas linhagens archaeais foram submetidos a análise metagenômica.[7][8]

Em 2019, uma equipe no Japão conseguiu cultivar um micróbio a partir de sedimentos do fundo do mar e sequenciou o genoma da cepa MK-D1 de Prometheoarchaeum syntrophicum, é membro deste superfilo.[9][10]


Classificação

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A relação filogenética desse grupo ainda está em discussão. O relacionamento dos membros é aproximadamente o seguinte:[12][13]

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Asgard

Moldura verde: Asgard

  1. Violette Da Cunha, Morgan Gaia, Daniele Gadelle, Arshan Nasir, Patrick Forterre: Lokiarchaea are close relatives of Euryarchaeota, not bridging the gap between prokaryotes and eukaryotes, in: PLoS Genet. 2017 Jun; 13(6): e1006810. 2017 Jun 12, doi: 10.1371/journal.pgen.1006810
  2. Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna; Caceres, Eva F.; Saw, Jimmy H.; Bäckström, Disa; Juzokaite, Lina; Vancaester, Emmelien; Seitz, Kiley W.; Anantharaman, Karthik; Starnawski, Piotr (11 de janeiro de 2017). «Asgard archaea illuminate the origin of eukaryotic cellular complexity» (PDF). Nature (em inglês). 541 (7637): 353–358. Bibcode:2017Natur.541..353Z. ISSN 1476-4687. PMID 28077874. doi:10.1038/nature21031 
  3. Fournier GP, Poole AM. (2018). «A Briefly Argued Case That Asgard Archaea Are Part of the Eukaryote Tree». Front. Microbiol. 9. 1896 páginas. PMC 6104171Acessível livremente. PMID 30158917. doi:10.3389/fmicb.2018.01896 
  4. Eme, Laura; Spang, Anja; Lombard, Jonathan; Stairs, Courtney W.; Ettema, Thijs J. G. (10 de novembro de 2017). «Archaea and the origin of eukaryotes». Nature Reviews Microbiology (em inglês). 15 (12): 711–723. ISSN 1740-1534. PMID 29123225. doi:10.1038/nrmicro.2017.133 
  5. Devlin, Hannah (15 de janeiro de 2020). «Breakthrough gives insight into early complex life on Earth». The Guardian (em inglês). ISSN 0261-3077 
  6. You, Jia. «2017 in science: breakthroughs, breakdowns, and more». vis.sciencemag.org (em inglês). Consultado em 20 de dezembro de 2019 
  7. Jørgensen, Steffen Leth; Hannisdal, Bjarte; Lanzen, Anders; Baumberger, Tamara; Flesland, Kristin; Fonseca, Rita; Øvreås, Lise; Steen, Ida H; Thorseth, Ingunn H; Pedersen, Rolf B; Schleper, Christa (5 de setembro de 2012). «Correlating microbial community profiles with geochemical data in highly stratified sediments from the Arctic Mid-Ocean Ridge». PNAS. 109 (42): E2846–55. PMC 3479504Acessível livremente. PMID 23027979. doi:10.1073/pnas.1207574109 
  8. Jørgensen, Steffen Leth; Thorseth, Ingunn H; Pedersen, Rolf B; Baumberger, Tamara; Schleper, Christa (4 de outubro de 2013). «Quantitative and phylogenetic study of the Deep Sea Archaeal Group in sediments of the Arctic mid-ocean spreading ridge». Frontiers in Microbiology. 4. 299 páginas. PMC 3790079Acessível livremente. PMID 24109477. doi:10.3389/fmicb.2013.00299 
  9. Imachi, Hiroyuki; Nobu, Masaru K.; Nakahara, Nozomi; Morono, Yuki; Ogawara, Miyuki; Takaki, Yoshihiro; Takano, Yoshinori; Uematsu, Katsuyuki; Ikuta, Tetsuro (6 de agosto de 2019). «Isolation of an archaeon at the prokaryote-eukaryote interface». bioRxiv (em inglês). 726976 páginas. doi:10.1101/726976 
  10. Pennisi, Elizabeth (16 de agosto de 2019). «Tentacled microbe hints at how simple cells became complex». Science (em inglês). 365 (6454): 631–631. ISSN 0036-8075. PMID 31416944. doi:10.1126/science.365.6454.631 
  11. a b MacLeod, Fraser; Kindler, Gareth S.; Wong, Hon Lun; Chen, Ray; Burns, Brendan P. (2019). «Asgard archaea: Diversity, function, and evolutionary implications in a range of microbiomes». AIMS Microbiology. 5 (1): 48–61. ISSN 2471-1888. PMC 6646929Acessível livremente. PMID 31384702. doi:10.3934/microbiol.2019.1.48 
  12. Eme, Laura; Spang, Anja; Lombard, Jonathan; Stairs, Courtney W.; Ettema, Thijs J. G. (10 de novembro de 2017). «Archaea and the origin of eukaryotes». Nature Reviews. Microbiology. 15 (12): 711–723. ISSN 1740-1534. PMID 29123225. doi:10.1038/nrmicro.2017.133 
  13. Liu, Yang; Makarova, Kira S.; Huang, Wen-Cong; Wolf, Yuri I.; Nikolskaya, Anastasia; Zhang, Xinxu; Cai, Mingwei; Zhang, Cui-Jing; Xu, Wei; Luo, Zhuhua; Cheng, Lei; Koonin, Eugene V.; Li, Meng (28 de abril de 2021). «Expanding diversity of Asgard archaea and the elusive ancestry of eukaryotes». Nature. doi:10.1038/s41586-021-03494-3  Pré-impressão gratuita:
    Liu, Yang; Makarova, Kira S.; Huang, Wen-Cong; Wolf, Yuri I.; Nikolskaya, Anastasia; Zhang, Xinxu; Cai, Mingwei; Zhang, Cui-Jing; Xu, Wei; Luo, Zhuhua; Cheng, Lei; Koonin, Eugene V.; Li, Meng (20 de outubro de 2020). «Expanding diversity of Asgard archaea and the elusive ancestry of eukaryotes». bioRxiv (2). doi:10.1101/2020.10.19.343400 
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