CLEC4M (англ. C-type lectin domain family 4 member M, лектин С-типа домен семейство 4 член M; CD299), или L-SIGN, — мембранный белок, лектин типа С. Продукт гена человека CLEC4M[5].

CLEC4M
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1K9J, 1SL6, 1XAR, 1XPH, 3JQH

Идентификаторы
ПсевдонимыCLEC4M, CD209L, CD299, DC-SIGN2, DC-SIGNR, DCSIGNR, HP10347, L-SIGN, LSIGN, C-type lectin domain family 4 member M
Внешние IDOMIM: 605872 MGI: 2157942 HomoloGene: 129771 GeneCards: CLEC4M
Расположение гена (человек)
19-я хромосома человека
Хр.19-я хромосома человека[1]
19-я хромосома человека
Расположение в геноме CLEC4M
Расположение в геноме CLEC4M
Локус19p13.2Начало7,763,210 bp[1]
Конец7,769,605 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
8-я хромосома мыши
Хр.8-я хромосома мыши[2]
8-я хромосома мыши
Расположение в геноме CLEC4M
Расположение в геноме CLEC4M
Локус8|8 A1.1Начало3,793,397 bp[2]
Конец3,798,984 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001144904
NM_001144905
NM_001144906
NM_001144907
NM_001144908

NM_001144909
NM_001144910
NM_001144911
NM_014257
NM_214675
NM_214676

NM_133238

RefSeq (белок)
NP_001138376
NP_001138377
NP_001138378
NP_001138379
NP_001138380

NP_001138381
NP_001138382
NP_001138383
NP_055072

NP_573501

Локус (UCSC)Chr 19: 7.76 – 7.77 MbChr 8: 3.79 – 3.8 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Функции

править

Белок является мембранным белком 2-го типа. На 77% гомологичен белку CD209. Оба белка связывают белок клеточной адгезии ICAM-3 и вирусный белок HIV-1 gp120. Взаимодействие с HIV-1 gp120 повышает инфекцию вирусом T-лимфоцитов. Обнаружены множественные варианты белка из-за альтернативного сплайсинга. Ген CLEC4M находится на 19p13.3 в кластере с CD209 и CD23/FCER2[6].

Относится к рецепторам опознавания паттерна, участвует в периферийном иммунном ответе в печени. Может опосредовать эндоцитоз патогенов, ведущего к последующей деградации патогена в лизосомах. Рецептор ICAM3 и, возможно, маннозо-подобных углеводов.

Примечания

править
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000104938 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031494 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Yokoyama-Kobayashi M., Yamaguchi T., Sekine S., Kato S. Selection of cDNAs encoding putative type II membrane proteins on the cell surface from a human full-length cDNA bank (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1999. — April (vol. 228, no. 1—2). — P. 161—167. — doi:10.1016/S0378-1119(99)00004-9. — PMID 10072769.
  6. Entrez Gene: CLEC4M C-type lectin domain family 4, member M. Архивировано 21 августа 2018 года.

Литература

править