Эпитоп
Эпитоп (англ. epitope) или антигенная детерминанта — часть макромолекулы, которая распознается иммунной системой (антителами, B-клетками, Т-клетками). Часть антитела, распознающая эпитоп называется паратопом. Хотя обычно эпитопы относятся к чужеродным для данного организма белкам, участки собственных белков, распознаваемые иммунной системой, также называются эпитопами.
Большинство эпитопов, распознаваемых антителами или B-клетками, представляются как трехмерные структуры на поверхности молекул антигенов, которые точно совпадают по форме и пространственному расположению электрических зарядов с соответствующими паратопами антител. Исключение составляют линейные эпитопы, которые определяются последовательностями аминокислот в белке (первичные последовательности), а не трехмерной формой. Протяженность В-клеточного эпитопа может достигать 22 аминокислотных остатков.
Эпитопы для Т-клеток представлены на поверхности антиген-презентирующих клеток, где они связаны с молекулами комплекса гистосовместимости (MHC). Эпитопы, связанные с МНС первого типа обычно пептиды, состоящие из 8-11 аминокислот, в то время как MHC второго типа представляют более длинные пептиды, а нетипичные молекулы MHC также представляют не-пептидные эпитопы, такие как гликолипиды. Т-клеточные эпитопы могут быть только линейными, локализуются как на поверхности, так и внутри белков.
Эпитопы могут определяться такими иммуноферментными методами как ELISPOT и ELISA, и с использованием биочипов.
Генетические последовательности, кодирующие эпитопы, которые распознаются известными антителами, могут быть привязаны к известным генам, тем самым к генам добавляется молекулярная характеристика. Для этой цели используются эпитопы c-myc, HA, FLAG, V5.
В некоторых случаях эпитопы дают перекрестную реакцию. Это свойство используется иммунной системой в регуляции анти-идиотипических антител, существование которых было предположено нобелевским лауреатом Нильсом Кай Жерне (Niels Kaj Jerne). Если антитело связывается с эпитопом какого-то антигена, его паратоп може стать эпитопом (т.е. приобретает свойства антигена) для другого антитела. Если это второе антитело класса IgM, то его связывание усиливает иммунный ответ, если же оно класса IgG, то ослабляет.