Realm (Virologie)
Ein Realm (unübersetzte Übernahme von englisch realm []) ist in der Virus-Taxonomie der Virologie der höchste Rang, der vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) festgelegt wird. Die Namen von Realms werden mit der Endung -viria abgeschlossen.[1]
Benennung
Der englische Ausdruck realm[2] ist mehr oder weniger synonym, zumindest aber überlappend zum Ausdruck kingdom[3]. Beide bedeuten im Ursprung ein von einem König oder einer Königin regiertes Land, im übertragenen Sinn auch ein Aktivitäts- oder Interessengebiet. Aufgrund des geringen Alters der neuen Rangstufe hat sich derzeit noch keine deutsche Übersetzung etabliert. Die wörtliche Übersetzung kann leicht zur Konfusion mit der Rangstufe Reich (englisch kingdom) führen, in der Virustaxonomie eine dem Realm untergeordnete Rangstufe. Sehr selten, und bisher nur im angewandten Zusammenhang, wurde es als „Bereich“ übersetzt.[4]
Klassifikation
Ein Realm ist in Subrealms (englisch subrealms) mit Endung -vira unterteilbar. In der Virologie folgt auf Subrealm in der Rangfolge als nächstes Reich (englisch kingdoms) mit Endung -virae, danach folgen Unterreich und Phylum (oder Stamm) mit Endung -viricota. Die zulässigen Namensendungen für Realms sind -viria und für Subrealms -vira.[1]
Als oberste Rangstufe (noch oberhalb von Reich) entspricht Realm in etwa dem, was bei zellulären Organismen üblicherweise mit Domäne (englisch domain) bezeichnet wird. Anders als bei den Domänen dieser Organismen, für die nach der Abstammungslehre eine gemeinsame Abstammung angenommen wird (siehe Urvorfahr), stellen die Realms Bereiche der Viren dar, die auf unterschiedliche Weise entstanden sind und allenfalls jede für sich einen eigene (maximale) Klade (Verwandtschaftsgruppe) bilden.
Seit März 2020 gibt es die folgenden vom ICTV bestätigten Realms:[5]
- Adnaviria (filamentäre archaeale Viren, Baltimore-Gruppen 1, Klasse Tokiviricetes mit den Ordnungen Ligamenvirales und Primavirales (Familie Tristromaviridae)).[6]
- Duplodnaviria (dsDNA-Viren, d. h. Baltimore-Gruppe 1)[7]
- Varidnaviria (entspricht dem früheren Vorschlag „Divdnaviria“, ebenfalls dsDNA-Viren)[8]
- Monodnaviria (ssDNA-Viren, d. h. Baltimore-Gruppe 2, aber auch weitere dsDNA-Viren)[9]
- Riboviria (Baltimore-Gruppen 3, 4, 5 (fast alle RNA-Viren, jedoch ohne die Viroide der Familien Avsunviroidae, Pospiviroidae und der Gattung Deltavirus), sowie 6 und 7 — Retro- und Pararetroviren)
- Ribozyviria (Gattung Deltavirus und ähnliche, Baltimore 5)
- Varidnaviria (Baltimore 1, ursprünglich Divdnaviria, Vertical jelly roll major capsid protein DNA viruses, DJR-MCP-Viren)[10]
Unter den DNA-Viren sind mit diesem Stand weiterhin noch viele ohne zugeordneten Realm.
Literatur
- C. W. Ward: Progress towards a higher taxonomy of viruses. In: Research in Virology. 144. Jahrgang, Nr. 6, 1993, S. 419–453, doi:10.1016/S0923-2516(06)80059-2, PMID 8140287.
Einzelnachweise
- ↑ a b Virus Taxonomy: 2018 Release. (html) In: International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Oktober 2018, abgerufen am 8. März 2019 (englisch).
- ↑ realm im Cambridge Dictionary
- ↑ kingdom im Cambridge Dictionary
- ↑ Antwort der Bayerischen Staatsministerin für Gesundheit und Pflege zur schriftlichen Anfrage der Abgeordneten Franz Bergmüller et al. München, 16. Oktober 2020
- ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
- ↑ Aufgrund struktureller Ähnlichkeiten wurde vorgeschlagen, die Ordnung Ligamenvirales und die Familie Tristromaviridae in einer Klasse Tokiviricetes zu vereinen (toki bedeutet "Faden" auf Georgisch und -viricetes ist das offizielle Suffix für Virusklassen). Referenz: F. Wang, D. P. Baquero, Z. Su, T. Osinski, D. Prangishvili, E. H. Egelman, M. Krupovic: Structure of a filamentous virus uncovers familial ties within the archaeal virosphere. In: Virus Evolution. 6. Jahrgang, Nr. 1, Januar 2020, S. veaa023, doi:10.1093/ve/veaa023, PMID 32368353, PMC 7189273 (freier Volltext) – (oup.com).
- ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Human alphaherpesvirus 1, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
- ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Acanthamoeba polyphaga mimivirus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
- ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Primate erythroparvovirus 1, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
- ↑ Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH: Create a megataxonomic framework for DNA viruses encoding vertical jelly roll-type major capsid proteins filling all principal taxonomic ranks. ICTV Proposal 2019.003G, April–Juli 2019