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Deinococcota

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Deinococci

Les Deinococcota (Deinococcobactéries ou anciennement Deinococcobacteria ou groupe Deinococcus-Thermus) sont un petit phylum de bactéries composée de coques très résistantes aux risques environnementaux. Elle comprend la classe des Deinococci, elle-même divisée en deux ordres.

Décrit en sous le nom de groupe Deinococcus-Thermus par Weisburg et al. mais publié de manière non valide[2], ce taxon a été republié en pour se conformer aux règles de nomenclature de l'ICSP et rebaptisé Deinococcota en maintenant l'autorité d'invention à Weisburg mais avec la date de validation de 2021[1].

Étymologie

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L'étymologie de Deinococcota est la suivante : Dei.no.coc.co’ta N.L. masc. n. Deinococcus, genre type du phylum; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe pour définir un phylum; N.L. neut. pl. n. Deinococcota, le phylum des Deinococcus[1],[3].

Liste des classes

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Selon NCBI (12 novembre 2022)[4], le phylum Deinococcota ne compte qu'une seule classe :

  • Deinococci Garrity et Holt 2002

Deinococcus est composé de plusieurs espèces résistantes aux radiations. Ils sont devenus célèbres pour leur capacité à ingérer des déchets nucléaires et autres matières toxiques, de survivre dans le vide de l'espace et à des températures extrêmes.

Les Thermales comprennent plusieurs genres résistant à la chaleur. Thermus aquaticus est important dans le développement de la réaction en chaîne par polymérase où les cycles répétés de chauffage près de l'ADN font bouillir celui-ci qui utilise une enzyme thermo-stable vis-à-vis de l'ADN polymérase. Ces bactéries ont une épaisseur de parois cellulaires qui donnent des taches gram-positives, mais elles comprennent une deuxième membrane et sont donc plus proches de la structure Gram-negative. Cavalier-Smith appelle ce clade Hadobacteria (de Hadès, le souterrain).

Références

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  1. a b et c Oren et Garrity 2021, p. 3.
  2. Weisburg, Giovannoni et Woese 1989, p. 128.
  3. (en) « Phylum Deinococcota », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le )
  4. NCBI, consulté le 12 novembre 2022

Bibliographie

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  • (en) A Oren et GM Garrity, « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 71, no 10,‎ , p. 005056 (DOI 10.1099/ijsem.0.005056)
  • (en) WG Weisburg, SJ Giovannoni et CR Woese, « The Deinococcus-Thermus phylum and the effect of rRNA composition on phylogenetic tree construction », Syst Appl Microbiol, vol. 11,‎ , p. 128-134 (DOI 10.1016/S0723-2020(89)80051-7)

Liens externes

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