馬祖天后宮，又稱馬祖境天后宮、南竿天后宮，位於中華民國連江縣馬祖南竿鄉馬祖村4-1號 ，是一座奉祀海神媽祖的廟宇。
一般福建、臺灣人相傳媽祖廿八歲時羽化登天，但是馬祖人傳說媽祖因為父兄遭遇船難，於是投海拯救父兄，因而罹難，遺體漂流至南竿，鄉民為之設冢，尊為靈穴，建造天后宮奉祀之。
歷次整修靈穴，都有靈異事蹟。1963年國軍不慎引發火災，欲改建廟宇，在靈穴前鋪設地磚，次日地磚全部裂開。2002年打算遷移靈穴，但用以鑽地的地鑽全斷，又作罷。爾後廟方想要塗上油彩，卻上不了色。
登山家李小石曾背著本宮媽祖攀登喜馬拉雅山。
參考資料
