OPN1SW

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
OPN1SW
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи OPN1SW, BCP, BOP, CBT, opsin 1 (cone pigments), short-wave-sensitive, opsin 1, short wave sensitive
Зовнішні ІД OMIM: 613522 MGI: 99438 HomoloGene: 1291 GeneCards: OPN1SW
Пов'язані генетичні захворювання
тританопія[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001708
NM_001385125
NM_007538
RefSeq (білок)
NP_001699
NP_031564
Локус (UCSC) Хр. 7: 128.77 – 128.78 Mb Хр. 6: 29.38 – 29.39 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

OPN1SW (англ. Opsin 1, short wave sensitive) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 348 амінокислот, а молекулярна маса — 39 135[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRKMSEEEFYLFKNISSVGPWDGPQYHIAPVWAFYLQAAFMGTVFLIGFP
LNAMVLVATLRYKKLRQPLNYILVNVSFGGFLLCIFSVFPVFVASCNGYF
VFGRHVCALEGFLGTVAGLVTGWSLAFLAFERYIVICKPFGNFRFSSKHA
LTVVLATWTIGIGVSIPPFFGWSRFIPEGLQCSCGPDWYTVGTKYRSESY
TWFLFIFCFIVPLSLICFSYTQLLRALKAVAAQQQESATTQKAEREVSRM
VVVMVGSFCVCYVPYAAFAMYMVNNRNHGLDLRLVTIPSFFSKSACIYNP
IIYCFMNKQFQACIMKMVCGKAMTDESDTCSSQKTEVSTVSSTQVGPN

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.

Література

[ред. | ред. код]
  • Nathans J., Thomas D., Hogness D.S. (1986). Molecular genetics of human color vision: the genes encoding blue, green, and red pigments. Science. 232: 193—202. PMID 2937147 DOI:10.1126/science.2937147
  • Shimmin L.C., Mai P., Li W.H. (1997). Sequences and evolution of human and squirrel monkey blue opsin genes. J. Mol. Evol. 44: 378—382. PMID 9089077 DOI:10.1007/PL00006157
  • Sarkar G., Sommer S.S. (1989). Access to a messenger RNA sequence or its protein product is not limited by tissue or species specificity. Science. 244: 331—334. PMID 2565599 DOI:10.1126/science.2565599
  • Applebury M.L., Hargrave P.A. (1986). Molecular biology of the visual pigments. Vision Res. 26: 1881—1895. PMID 3303660 DOI:10.1016/0042-6989(86)90115-X
  • Weitz C.J., Went L.N., Nathans J. (1992). Human tritanopia associated with a third amino acid substitution in the blue-sensitive visual pigment. Am. J. Hum. Genet. 51: 444—446. PMID 1386496

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з OPN1SW переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1012 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
  5. UniProt, P03999 (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]