Кофермент B: различия между версиями

Кофермент B
Кофермент B
Общие
Систематическое; наименование	2-[(7-меркапто-1-оксогептил)амино]-3-фосфонооксибутановая кислота
Хим. формула	C11H22NO7PS
Рац. формула	C11H22NO7PS
Физические свойства
Молярная масса	343.333641 г/моль
Классификация
Рег. номер CAS	104302-77-4
PubChem	350
SMILES	O=C(NC(C(=O)O)C(OP(=O)(O)O)C)CCCCCCS
InChI	InChI=1S/C11H22NO7PS/c1-8(19-20(16,17)18)10(11(14)15)12-9(13)6-4-2-3-5-7-21/h8,10,21H,2-7H2,1H3,(H,12,13)(H,14,15)(H2,16,17,18)/t8-,10+/m1/s1 JBJSVEVEEGOEBZ-SCZZXKLOSA-N
ChEBI	28890
ChemSpider	343
Безопасность
NFPA 704	0 0 0
	Приведены данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иное.
	Медиафайлы на Викискладе

Интерактивная навигация по истории

[отпатрулированная версия]

← Предыдущая правка

Содержимое удалено Содержимое добавлено

ВизуальныйВики-текст

Линейный

Текущая версия от 07:09, 5 мая 2023

Кофермент В, Coenzyme B (2-[(7-меркапто-1-оксогептил)амино]-3-фосфонооксибутановая кислота) — это кофермент, принимающий участие в окислительно-восстановительных реакциях у метаногенов.^[1] Молекула кофермента В содержит тиол, который принимает участие в механизме реакции.

В процессе метаногенеза кофермент B реагирует с 2-метилтиоэтансульфонатом (метил-Кофермент M, аббревиатура CH₃-S-CoM), и при этом освобождается метан^[2]:

CH₃-S-CoM + HS-CoB → CH₄ + CoB-S-S-CoM

Это превращение катализируется ферментом метил-кофермент М-редуктазой которая содержит кофактор F430 как простетическую группу.

При восстановлении фумарата в сукцинат ферментом фумарат-редуктазой требуются одновременно и HS-CoB и HS-CoM^[3]:

CH₃-S-CoM + HS-CoB ⁻O₂CCH=CHCO₂⁻ → ⁻O₂CCH₂-CH₂CO₂⁻ + CoB-S-S-CoM

Примечания

↑ Noll K.M., Rinehart K.L., Tanner R.S., Wolfe R.S. Structure of component B (7-mercaptoheptanoylthreonine phosphate) of the methylcoenzyme M methylreductase system of Methanobacterium thermoautotrophicum (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1986. — Vol. 83, no. 12. — P. 4238—4242. — doi:10.1073/pnas.83.12.4238. — PMID 3086878.
↑ Thauer, R. K., «Biochemistry of Methanogenesis: a Tribute to Marjory Stephenson», Microbiology, 1998, volume 144, pages 2377—2406
↑ Heim, S.; Künkel, A.; Thauer, R. K.; Hedderich, R. «Thiol:fumarate Reductase (Tfr) from Methanobacterium thermoautotrophicum: Identification of the Catalytic Sites for Fumarate Reduction and Thiol Oxidation» European Journal of Biochemistry 1998, volume 253, pages 292—299.

[1] Noll K.M., Rinehart K.L., Tanner R.S., Wolfe R.S. Structure of component B (7-mercaptoheptanoylthreonine phosphate) of the methylcoenzyme M methylreductase system of Methanobacterium thermoautotrophicum (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1986. — Vol. 83, no. 12. — P. 4238—4242. — doi:10.1073/pnas.83.12.4238. — PMID 3086878.

[2] Thauer, R. K., «Biochemistry of Methanogenesis: a Tribute to Marjory Stephenson», Microbiology, 1998, volume 144, pages 2377—2406

[3] Heim, S.; Künkel, A.; Thauer, R. K.; Hedderich, R. «Thiol:fumarate Reductase (Tfr) from Methanobacterium thermoautotrophicum: Identification of the Catalytic Sites for Fumarate Reduction and Thiol Oxidation» European Journal of Biochemistry 1998, volume 253, pages 292—299.

[1]

[2]

[3]

@@ Строка 1: / Строка 1: @@
+{{Вещество
-[[Файл:CoB.png|thumb|400px|Кофермент В]]
+ | заголовок                 = <!-- заголовок карточки
+                                    (по умолчанию совпадает с названием страницы) -->
+ | картинка                  = Coenzyme B (CoB).svg
+ | картинка3D                = <!-- имя файла с 3D-визуализацией молекулы вещества -->
+ | картинка малая            = <!-- имя файла -->
-'''Кофермент В, Coenzyme B''' (2-[(7-меркапто-1-оксогептил)амино]-3-фосфонооксибутановая кислота) — это [[кофермент]], принимающий участие в окислительно-восстановительных реакциях у [[метаногено]]в.<!--
+ | наименование              = 2-[(7-меркапто-1-оксогептил)амино]-3-фосфонооксибутановая кислота
+ | традиционные названия     = <!-- если есть — бытовые, народные, исторические и т. п. -->
+ | сокращения                = <!-- принятые сокращения названия -->
+ | хим. формула              = <!-- формула, отображающая количественный состав
+                                    вещества (элементы и кол-во их атомов);
+                                    используйте шаблон {{Химическая формула}} -->
+ | рац. формула              = C<sub>11</sub>H<sub>22</sub>NO<sub>7</sub>PS
+ | состояние                 = <!-- твёрдое/жидкость/газ -->
+ | примеси                   = <!-- типичное кол-во, указать единицы -->
+ | молярная концентрация     = <!-- число, в моль/л -->
+ | молярная масса            = 343.333641
+ | плотность                 = <!-- число, в г/см³ -->
+ | предел прочности          = <!-- число, в Н/мм² -->
+ | твёрдость                 = <!-- число (безразм.) -->
+ | поверхностное натяжение   = <!-- число, Н/м -->
+ | динамическая вязкость     = <!-- число, в Па·с (при 20 °C) -->
+ | кинематическая вязкость   = <!-- число, в см²/с (при 20 °C) -->
+ | скорость звука            = <!-- число, в м/с -->
+ | энергия ионизации         = <!-- число, в кДж/моль -->
+ | проводимость              = <!-- число (удельная проводимость), в сименсах/м -->
+ | уд. электр. сопротивление = <!-- число, в Ом·м -->
+ | коэфф. электр. сопротив.  = <!-- число (температурный коэфф. эл. сопротивл.), в К^-1 -->
+ | темп. плавления           = <!-- число, в °C -->
- --><ref>{{cite journal |author=Noll KM, Rinehart KL, Tanner RS, Wolfe RS |title=Structure of component B (7-mercaptoheptanoylthreonine phosphate) of the methylcoenzyme M methylreductase system of Methanobacterium thermoautotrophicum |journal=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |volume=83 |issue=12 |pages=4238–42 |year=1986 |pmid=3086878 |url=http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pubmed&pubmedid=3086878 |doi=10.1073/pnas.83.12.4238}}</ref><!--
+ | температура размягчения   = <!-- число, в °C - для аморфных веществ -->
+ | темп. кипения             = <!-- число, в °C -->
+ | темп. кипения пр.         = <!-- число с указанием единицы измерения,
+                                     возможно описание условий -->
+ | темп. сублимации          = <!-- число, в °C — для сублимирующихся веществ -->
+ | темп. разложения          = <!-- число, в °C -->
+ | темп. вспышки             = <!-- число, в °C -->
+ | фазовые переходы          = <!-- числа через запятую, с указанием единиц измерения -->
+ | темп. стеклования         = <!-- число, в °C -->
+ | темп. воспламенения       = <!-- число, в °C -->
+ | темп. самовоспламенения   = <!-- число, в °C -->
+ | пределы взрываемости      = <!-- число %-->
+ | тройная точка             = <!-- ? K (? °C), ? Па -->
+ | критическая точка         = <!-- ? K (? °C), ? Па -->
+ | критическая темп.         = <!-- число, в °C -->
+ | критическое давление      = <!-- число, в атм -->
+ | критическая плотность     = <!-- число, в см³/моль -->
+ | теплоёмкость              = <!-- число, в Дж/(моль·К) (молярная теп.-ём.) -->
+ | теплоёмкость2             = <!-- число, в Дж/(кг·К) (удельная теп.-ём.) -->
+ | теплопроводность          = <!-- число, в Вт/(м·K) -->
+ | энтальпия образования     = <!-- число, в кДж/моль -->
+ | энтальпия плавления       = <!-- число, в кДж/моль -->
+ | энтальпия кипения         = <!-- число, в кДж/моль -->
+ | энтальпия растворения     = <!-- число, в кДж/моль -->
+ | энтальпия сублимации      = <!-- число, в кДж/моль -->
+ | удельная теплота парообразования = <!-- число, в Дж/кг -->
+ | удельная теплота плавления       = <!-- число, в Дж/кг -->
+ | тепловое расширение       = <!-- число (безразм.) -->
+ | интервал трансформации    = <!-- число, в ° -->
+ | давление пара             = <!-- число (с указанием ед. изм!);
+                                    можно добавить любой текст -->
+ | константа В. дер В.       = <!-- число -->
+ | конст. диссоц. кислоты    = <!-- число (безразм.) -->
+ | растворимость             = <!-- число, в г/100 мл -->
+ | растворимость1            = <!-- число, в г/100 мл -->
+ |   вещество1               = <!-- веществе 1 -->
+ | растворимость2            = <!-- число, в г/100 мл -->
+ |   вещество2               = <!-- веществе 2 -->
+ | растворимость3            = <!-- число, в г/100 мл -->
+ |   вещество3               = <!-- веществе 3 -->
+ | растворимость4            = <!-- число, в г/100 мл -->
+ |   вещество4               = <!-- веществе 4 -->
+ | вращение                  = <!-- число, в ° -->
+ | изоэлектрическая точка    = <!-- число (безразм.) -->
+ | от. диэлектр. прониц.     = <!-- число -->
+ | диапазон прозрачности     = <!-- число-число, в нм -->
+ | показатель преломления    = <!-- число (безразм.) -->
+ | угол Брюстера             = <!-- число, в ° -->
+ | гибридизация              = <!-- ? -->
+ | координационная геометрия = <!-- ? -->
+ | кристаллическая структура = <!-- описание решётки -->
+ | дипольный момент          = <!-- число, в дебаях -->
+ | CAS                       = 104302-77-4
+ | PubChem                   =  350
+ | EINECS                    = <!-- № по EINECS -->
+ | SMILES                    =O=C(NC(C(=O)O)C(OP(=O)(O)O)C)CCCCCCS
+ | ЕС                        = <!-- Регистрационный № EC -->
+ | RTECS                     = <!-- № по  RTECS -->
+ | ChEBI                     = <!-- № по  ChEBI -->
+ | ООН                       = <!-- № по  ООН -->
+ | ПДК                       = <!-- число, в г/м3 -->
+ | ЛД50                      = <!-- число, в мг/кг -->
+ | R-фразы                   = <!-- фразы, каждая в двойных фигурных скобках, через запятую -->
+ | S-фразы                   = <!-- фразы, каждая в двойных фигурных скобках, через запятую -->
+ | H-фразы                   =
+ | P-фразы                   =
+ | токсичность               = <!-- любой описательный текст -->
+ | NFPA 704                  =  {{NFPA 704
+   | опасность для здоровья  = 0
+   | огнеопасность           = 0
+   | реакционноспособность    = 0
+   | прочее                  =
+}}
+}}
+'''Кофермент В, Coenzyme B''' (2-[(7-меркапто-1-оксогептил)амино]-3-фосфонооксибутановая кислота) — это [[кофермент]], принимающий участие в окислительно-восстановительных реакциях у [[метаноген]]ов.<!--
+ --><ref>{{статья |заглавие=Structure of component B (7-mercaptoheptanoylthreonine phosphate) of the methylcoenzyme M methylreductase system of Methanobacterium thermoautotrophicum |издание=[[Proceedings of the National Academy of Sciences|Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America]] |том=83 |номер=12 |страницы=4238—4242 |pmid=3086878 |ссылка=http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pubmed&pubmedid=3086878 |doi=10.1073/pnas.83.12.4238 |язык=en |тип=journal |автор=Noll K.M., Rinehart K.L., Tanner R.S., Wolfe R.S. |год=1986}}</ref><!--
  --> Молекула кофермента В содержит [[тиол]], который принимает участие в механизме реакции.
-В процессе [[метаногенез]]а [[кофермент B]] реагирует с [[2-метилтиоэтансульфонат]]ом (метил-[[Кофермент M]], аббревиатура CH<sub>3</sub>-S-CoM), и при этом освобождается [[метан]]<!--
+В процессе [[метаногенез]]а '''кофермент B''' реагирует с [[2-метилтиоэтансульфонат]]ом (метил-[[Кофермент M]], аббревиатура CH<sub>3</sub>-S-CoM), и при этом освобождается [[метан]]<!--
  --><ref>Thauer, R. K., «Biochemistry of Methanogenesis: a Tribute to Marjory Stephenson», Microbiology, 1998, volume 144, pages 2377—2406</ref>:
-: [[Кофермент M|CH<sub>3</sub>-S-CoM]] + HS-CoB &rarr; CH<sub>4</sub> + CoB-S-S-CoM
+: [[Кофермент M|CH<sub>3</sub>-S-CoM]] + HS-CoB → CH<sub>4</sub> + CoB-S-S-CoM
-Это превращение [[катализ]]ируется ферментом метил-кофермент М-редуктазой которая содержит [[кофактор]] [[F430]] как [[Простетическая группа|простетическую группу]].
+Это превращение [[катализ]]ируется ферментом метил-кофермент М-редуктазой которая содержит [[кофактор]] F430 как [[Простетическая группа|простетическую группу]].
 При восстановлении [[фумарат]]а в [[сукцинат]] ферментом [[фумарат-редуктаза|фумарат-редуктазой]] требуются одновременно и [[Кофермент В|HS-CoB]] и [[Кофермент М|HS-CoM]]<!--
  --><ref>Heim, S.; Künkel, A.; Thauer, R. K.; Hedderich, R. «Thiol:fumarate Reductase (Tfr) from ''Methanobacterium thermoautotrophicum'': Identification of the Catalytic Sites for Fumarate Reduction and Thiol Oxidation» European Journal of Biochemistry 1998, volume 253, pages 292—299.</ref>:
-: CH<sub>3</sub>-S-CoM + HS-CoB <sup>-</sup>O<sub>2</sub>CCH=CHCO<sub>2</sub><sup>-</sup> &rarr; <sup>-</sup>O<sub>2</sub>CCH<sub>2</sub>-CH<sub>2</sub>CO<sub>2</sub><sup>-</sup> + CoB-S-S-CoM
+: CH<sub>3</sub>-S-CoM + HS-CoB <sup>−</sup>O<sub>2</sub>CCH=CHCO<sub>2</sub><sup>−</sup> → <sup>−</sup>O<sub>2</sub>CCH<sub>2</sub>-CH<sub>2</sub>CO<sub>2</sub><sup>−</sup> + CoB-S-S-CoM
 == Примечания ==
 {{примечания}}
 {{Кофакторы ферментов}}
 {{biochem-stub}}
+[[Категория:Коферменты]]
-[[en:Coenzyme B]]
-[[es:Coenzima B]]
-[[ja:補酵素B]]

Коферменты
Витамины	Пиридоксальфосфат (B6) Биотин (H) Тиаминпирофосфат (B1) ФМН, ФАД (B2) НАД, НАДФ (B3) Кофермент A (В5) Тетрагидрофолат, Дигидрофолат, Метилентетрагидрофолат (B9) Аскорбиновая кислота (C) Витамин К Метилкобаламин, Кобамамид (В12)
Не витамины	Гем (A, B, C, O) Липоевая кислота Молибдоптерин Пирролохинолинхинон Кофермент F420 Кофактор F430 АТФ ЦТФ S-Аденозилметионин АФС ФАФС Глутатион Кофермент B Кофермент М Убихинон (Кофермент Q) Метанофуран Тетрагидробиоптерин Метаноптерин
Биологически значимые элементы	Ca²⁺ Cu²⁺ Fe²⁺, Fe³⁺ Mg²⁺ Mn²⁺ Mo Ni²⁺ Se Zn²⁺ Co²⁺

Кофермент B

Общие
Систематическое наименование	2-[(7-меркапто-1-оксогептил)амино]-3-фосфонооксибутановая кислота
Хим. формула	C₁₁H₂₂NO₇PS
Рац. формула	C₁₁H₂₂NO₇PS
Физические свойства
Молярная масса	343.333641 г/моль
Классификация
Рег. номер CAS	104302-77-4
PubChem	350
SMILES	O=C(NC(C(=O)O)C(OP(=O)(O)O)C)CCCCCCS
InChI	InChI=1S/C11H22NO7PS/c1-8(19-20(16,17)18)10(11(14)15)12-9(13)6-4-2-3-5-7-21/h8,10,21H,2-7H2,1H3,(H,12,13)(H,14,15)(H2,16,17,18)/t8-,10+/m1/s1 JBJSVEVEEGOEBZ-SCZZXKLOSA-N
ChEBI	28890
ChemSpider	343
Безопасность
NFPA 704	0 0 0
Приведены данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иное.
Медиафайлы на Викискладе

Кофермент B: различия между версиями

Текущая версия от 07:09, 5 мая 2023

Примечания

Навигация

Поиск